पंडित यमुना करजी का जन्म 1898 में बिहार के दरभंगा जिले में पूसा के पास एक छोटे से गाँव देओपर में हुआ था। उनके पिता अनु करजी एक किसान थे, जिनकी मृत्यु तब हुई जब यमुना करजी की उम्र केवल 6 महीने थी।
अपने स्कूल के दिनों से ही, वह सहजानंद सरस्वती के नेतृत्व में भारत के स्वतंत्रता संग्राम और किसान आंदोलन और किसान आंदोलन की ओर आकर्षित हो गए थे। किसान आंदोलन में वे अन्य क्रांतिकारी किसान नेताओं जैसे कार्यानंद शर्मा, यदुनंदन शर्मा और पंचानन शर्मा के करीबी सहयोगी बन गए।
उच्च अध्ययन के लिए वे प्रेसीडेंसी कॉलेज, कलकत्ता गए और कानून की डिग्री भी प्राप्त की। कलकत्ता में वे कई स्वतंत्रता सेनानियों और बिधान चंद्र रॉय, श्रीकृष्ण सिन्हा और राहुल सांकृत्यायन जैसे कांग्रेसी नेताओं के संपर्क में आए।
कई सरकारी नौकरियों के प्रस्तावों को ठुकराते हुए, वह एक प्रतिष्ठित हिंदी पत्रकार बन गए। वह कलकत्ता में प्रकाशित हिंदी साप्ताहिक भारत मित्र के संपादकीय विंग में शामिल हुए। उन्होंने 1920-21 से गांधीजी के असहयोग आंदोलन में भी भाग लिया और सविनय अवज्ञा आंदोलन और सत्याग्रह में भाग लेने के कारण 1929-30 में जेल गए।
उन्होंने 1937 में कांग्रेस उम्मीदवार के रूप में बिहार और उड़ीसा विधानसभा के लिए पहला चुनाव जीता।
उन्होंने राहुल सांकृत्यायन, रामधारी सिंह दिनकर और अन्य लोकप्रिय हिंदी लेखकों और शिक्षाविदों के साथ 1940 में बिहार से हुंकार नाम से एक हिंदी साप्ताहिक का प्रकाशन शुरू किया। इस काम को उनके सम्मानित गांधीवादी मित्र और रिश्तेदार बशिष्ठ नारायण शर्मा ने निर्देशित किया, जो प्रेसीडेंसी कॉलेज कलकत्ता से स्नातक थे। गुरुजी (मास्टर साहब) के नाम से लोकप्रिय बिहार प्रांतीय सेवाओं में शामिल होने से इनकार कर दिया। हुंकार बाद में बिहार में किसान आंदोलन और कृषि आंदोलन का मुखपत्र बन गया। यमुना कारजी कुछ समय के लिए किसान सभा के अध्यक्ष भी रहे।
अक्टूबर 1953 में 55 वर्ष की कम उम्र में कैंसर से उनकी मृत्यु हो गई। उनके असामयिक निधन के बाद बिहार में किसान आंदोलन ने गति खो दी और दिशाहीन हो गया। उनका नाम बिपिन चंद्रा की उत्कृष्ट कृति भारत की स्वतंत्रता के लिए संघर्ष में भी दिखाई देता है। यमुना कारजी के नाम पर मुजफ्फरपुर के पास एक कॉलेज है।
उनके पोते देवेश कुमार करजी बिहार में भारतीय जनता पार्टी के उपाध्यक्ष रहे हैं। 2021 से वह बिहार विधान परिषद के सदस्य भी हैं।